１．忍者

　２０２×年、この世界では忍者は滅んでおらず、スパイや工作員として、国家の重要な役割を任されていた。
　また優れた「ニンジャ・システム」は欧米・中東・アジアなど世界百ケ国以上の諜報機関で採用され、世界中で忍者は活躍している。
 

２．生駒山学園

　奈良県生駒山山中にある、日本で最も優れた忍者養成機関。
　能力至上主義で、優秀な生徒しか採らないため、生徒数は一学年一ケタになってしまうことも多い。
 

３．超昆虫要塞アリノス

　古生代石炭紀、巨大昆虫の時代に進化した蟻人（アリ人間）たちは、人類に匹敵するほどの高度な文明を築いていた。氷河期の到来で三億年の間、冬眠状態に入っていたが、１９５４年のアメリカの核実験の影響で長い眠りから目覚め、その後、人類の目に触れぬよう地中奥深くで繁殖し、約６０年が過ぎた現在では、その数を一万匹までに増やしている。
　そして地球上の哺乳類を一掃し、全世界を蟻人の手に取り戻すために暗躍を開始した。
　主人公たち忍者は、アリノスとの戦いで先陣に立つことになる。